Dominikonų bažnyčia Šv Nikolajus - vienas iš seniausių šventyklų, esantys Gdanskas, buvo sukurtas 12-ojo amžiaus pabaigoje. Pirmas mažas bažnyčia, skirta Šv Nikolajus buvo pastatytas 1185. Ji buvo sukurta dviejų svarbiausių prekybos kelių kryžkelėje: senovės takeliai pirklius ir kelio, kuris veda iš Karališkosios pilies Pomeranijos. Bažnyčia atėjo kaip vietinių gyventojų ir atvykstančių pirklių ir jūreivių. Sausio 1227 Pamario princas Svyatopolk davė Bažnyčios Dominikos tvarką Jacek Odrovatsa veidą. Netrukus bažnyčia buvo paversta vienuolyną. 1260, Aleksandras IV suteiktas Gdanskas privilegiją, nes miestas pradėjo atvyksta piligrimų. 1348, darbai prasidėjo nuo vienuolyno plėtrą. 1487 ten buvo žvaigždžių skliautas buvo baigtas aštuonkampis skliautas.

Per Reformacijos, vienuolynas ne kartą buvo apiplėšti ir iš dalies sunaikinti 1525 ir 1576 atitinkamai. Vienuoliai buvo išvaryti iš vienuolyno, kai kurie iš jų buvo nužudyti. Po karaliaus Žygimanto Augusto intervencijos 1567, grįžo į dominikonų vienuolyną.

Spalio 1587 karalius Žygimantas III prisiekė savo pareigas, susijusias su tos šalies, į vienuolyną. Nuo to momento prasidėjo klestėjimo laikotarpis. Čia ne tik suklestėjo dvasinį gyvenimą, bet taip pat turi galimybių pirkti naują kūnas, altoriaus remonto. Vėlyvą 17 Century Gothic koplyčia buvo pastatyta šiaurinėje altoriaus. 1834 dominikonai paliko miestą, o bažnyčia tapo viena iš keturių katalikų Gdanske.

Per Antrąjį pasaulinį karą bažnyčia buvo sugriauta. Pasak legendos, kunigas papirko Raudonosios armijos anketa geros nuotaikos karius, todėl kareiviai apiplėšė ir sudegino bažnyčią. 1945 balandžio po 111 metų nėra, dominikonai jau atgimsta Gdanskas ir bažnyčios.

Pasibaigus 60-ųjų pabaigoje bažnyčia buvo susibūrimo vieta opozicija. Tėvas Luisas Wisniewski surengė susitikimą, kuriame dalyvavo aukštųjų mokyklų studentams, po studentams ir politiką.