Senovės inkų miestas Choquequirao yra iš Salkantay kalnų spurs ne apie 3030 m virš jūros lygio, 98 km nuo Cusco mieste aukštyje. Tai senovės miestas yra laikomas "sesuo miestas Maču Pikču," dėl savo panašumo į architektūros ir struktūros.

Choquequirao buvo pastatyta inkų XV amžiuje. Miestas turėjo dvi pagrindines vystymosi etapus. Tai gali būti paaiškinama tuo, kad miestas buvo įkurtas Pachacutec Choquequirao - devintos inkų imperatorius (1438-1471), po kurio jo sūnus Tupac inkų Yupanqui, tampa dešimtąjį imperatorius (1471-1493), atstatytas ir pratęsė savo gyvenimą. Dokumentai kolonijiniai laikai rodo, kad Tupac inkų Yupanqui nusprendė Choquequirao, kaip jo proanūkiu - Tupac Sauri - patvirtinantis teritorijoje ir kaimyninių žemių nuosavybę per Ispanijos kolonizacijos.

Choquequirao tikriausiai buvo vienas iš perėjimo punktų prie Vilcabamba mieste - paskutinis prieglobstis inkų iki 1572, taip pat administracinis centras atlikti politines, socialines ir ekonomines funkcijas. Gatvėse galima pamatyti simbolines modelius imperijos sostinėje, už ritualų vieta, dvarai bajorų, namai, amatininkų, sandėliuose, didelių bendrabučių ir ūkininkavimo terasomis.

Per pastarąjį dešimtmetį, Peru vyriausybė bando pritraukti daugiau mokslininkų domisi Inkai kultūros susigrąžinti iš dalies iškastą Choquequirao ir padaryti jį labiau prieinamą turistams tyrimas. Norėdami gauti ten, turistai vadovaujasi įveikti kelio ilgį 60 kilometrų per 4 dienas vienoje iš giliausių kanjonų pasaulyje, per kuri teka upė Apurimakas. Tai kanjonas yra žinomas dėl savo snieguotų viršūnių, žalios šlaitų Amazonės džiunglėse ir stačios uolos. Ekskursija į Choquequirao griuvėsiai kruopščiai sukurta siekiant parodyti turistams realiame gyvenime Anduose. Šiuo metu yra trys keliai, dėl kurių Choquequirao - per Kachora per Huanipaka ir į Yanam.

Pastaraisiais metais daugiau nei 5000 žmonių kasmet pademonstravo įspūdingą kelionę į jo Choquequirao griuvėsiai.