Muziejaus liaudies meno ir amatų, esančių Zagrebe, įkurta 1880 metais ant menų draugijos iniciatyva. Muziejus buvo vienas iš pirmųjų institucijų tokio pobūdžio Europoje. 1882 metais muziejus sukūrė mokyklą amatai, kuris dabar Taikomosios dailės ir dizaino mokykla. Muziejaus pastatas buvo suprojektuotas architekto Hermano Bolle į Vokietijos renesanso dvasia.

Pagrindinis muziejaus fondas inicijavo keletą metų prieš oficialų atidarymą vyskupo Strossmayer. Izidoriaus Krshnyaviya dovanas Paryžiaus aukcione 1875 įsigijo Katalonijos menininko ir kolektoriaus Marian Fortuna posėdyje. Nuo 1880 kolekcija praturtino ne tik Kroatijos, bet ir visoje Europoje. Daug muziejų fondo buvo gauta iš privačių kolekcininkų.

Pirmaisiais metais muziejus buvo įsikūręs nuomojamo pastato gatvėje Marija Valeria (dabar - gatvė Prahoje). Muziejus persikėlė į dabartinę pastato 1909 metais tuo pačiu metu buvo atvira, o nuolatinė paroda. 1919 metais muziejus buvo atidarytas Šiuolaikinio meno muziejus. Vėliau, iš Zagrebo muziejaus liaudies meno ir amatų atskirti Etnografijos muziejus.

Nuo 1933 1952 Muziejus buvo pagal Vladimiro Tkalich kryptimi. Per šį laikotarpį, nauja paroda buvo sukurta, susidedanti iš nuotraukos, brėžiniai ir spausdintos produkcijos. Muziejus įkurtas restauravimo dirbtuves. Nuo 1950 parodos Muziejai aktyviai.

Po Jugoslavijos žlugimo ir karinių veiksmų šio laikotarpio muziejus buvo atidarytas 1995 po renovacijos ir restauravimo pastato. Šiandien muziejaus kolekcija yra apie 100 tūkstančių. Objektai vaizduojamosios ir taikomosios dailės, datuotą 14-21 šimtmečius. Muziejaus daugiau nei 65 tūkstančių biblioteka. Knygos meno ir amatų.