Ekskursija po parką Ueno nebūtinai veda svečias Japonijos sostinėje nacionalinio muziejaus gamtos ir mokslo, įsikūręs šiaurės rytinėje parko. Ekspozicija apima daugiau nei 14 tūkstančių eksponatų ir pasakoja apie pasaulio kilmę apskritai ir ypač Japonijos salynas, taip pat apie pokyčius, įvykusius jų istoriją, nes prie šios dienos pradžioje.

Muziejus buvo atidarytas 1871 metais ir nuo tada pasikeitė kelis pavadinimus - tai buvo Švietimo ir muziejus ir Tokijo muziejus ministerija, o 2007 m neįgijo savo dabartinį pavadinimą. Per XX amžiaus pabaigoje ir šio amžiaus pradžioje, muziejus išgyveno modernizacijos. Jo pagrindinis pastatas buvo paskelbta kultūros paveldas tautos, dabar japonų galerija, ten taip pat yra 3D kino teatras "teatras 360". Naujasis muziejaus pastatas yra atvira pasaulio galerija. Prieš įeinant muziejus įrengė mėlynos banginis figūra visu dydžiu.

Šeši aukštų Pasaulinio galerijoje kalbėti apie gyvybės evoliuciją Žemėje, gamtos dėsnius, į dinozaurų ir rūšių įvairovės kilmę. Atskiri skyriai yra skirti mokslo ir technologijų bei atstovų gyvūnų pasaulyje plėtrai. Sodo įsikūręs ant galerijos stogo, prisikėlimo apie 160 rūšių vaistinių ir aromatinių žolių, ir yra skėčiai nuo saulės, kurie yra atskleista žmogaus požiūrį į juos. Šioje galerijoje lankytojai gali laisvai laikyti ar gauti fizinę patirtį į interaktyvų medienos.

Japonijos Galerija įsikūrusi buvusio pagrindinio pastato, pastatytas 1930. Štai kas buvo Japonijos salynas per ledynmetį, jūs galite pamatyti mineralų, meteoritai, fosilijų kolekciją, sužinoti apie gyvūnų, gyvenančių salyno salų, išsiaiškinti, kas buvo žemės ūkio įranga su. Atskiras skyrius skirtas ryžių vaidmenį Japonijos gyvenime.

3D-kino teatras "teatras 360", kuris yra tame pačiame pastate, buvo perduotas į muziejų po tarptautinėje parodoje "Expo 2005", kurioje ji pirmą kartą buvo pristatytas lankytojams Japonijos paviljonas pabaigoje. Tai sferinės besiūlių ekranas su 12, 8 metrų skersmens. Šis dydis buvo pasirinktas: figūra - Viskas apie viena milijonoji mūsų planetos skersmens. Skaičius 360 kino pavadinimas yra matymo kampas. Į atsižvelgiant į rutulio centro kino auditoriją, o jos kupolas filmai prognozuojama apie visatą, dinozaurų ir žemynų kilmės. Keturi iš jų buvo sukurtos muziejaus darbuotojai.