1647 iš Eisenstadt miestas buvo prie kunigaikščių rūmų Esterházy, kuris turėjo didelę įtaką miesto ir davė teigiamų pokyčių taisyklę. 1648, dekretu imperatoriaus Ferdinando III Eisenstadt tapo nemokama miestas, apmokestinamos išmokamos 16000 guldenų ir 3000 barelių vyno sumos. 1670 Paulius I leista įsikurti Eisenstadt ir šeši netoliese gyvenviečių 3000 žydai, kurie buvo išvaryti iš Vienos. Rabinas miestas buvo Vertaymer Samsonas, kuris pats buvo palaidotas senosiose žydų kapinėse.

Nebuvo kapinėse poreikis. Taigi ten buvo senas žydų kapinės 17 amžiuje šalia žydų kvartale. Senos kapinės veikė nuo 1679 iki 1875 metų ir dirba apie 1140 antkapiai su tik hebrajų užrašais. Dėl ribotos erdvės, šalia senųjų kapinių buvo įkurtas naujas. Naujas kapinės buvo naudojamas nuo 1875 m.

Nacių okupacijos metu, abi kapinės iš dalies sunaikinti, ir antkapiai buvo naudojamas aplink miesto užtvara. Po 1945 kapinės buvo renovuotas ir paminklai buvo įdiegtos. 1992 naujas kapines vandalizmas įvyko: apie 80 antkapiai buvo išniekinta nacistinius simbolius.

Kapinės Eisenstadt skiriasi nuo kitų senovės žydų kapinės trūksta augmenijos. Tačiau jis yra labai panašus į formą ir išvaizdą Vienos kapinėse. Taip yra dėl to, kad pirmieji gyventojai buvo Vienos Migrantai. Prieš prie senųjų kapinių įėjimo buvo per gražus pusapvalis metalo vartai, tačiau dabar jie nebuvo išsaugotas. Abu kapinės yra atviros visuomenei.