Istorijos muziejus Aquitaine Bordeaux laikosi skaičių antroje pusėje XVIII amžiuje - nuo to momento, Bordo akademija buvo įkurta Akmens skulptūrų muziejus, kuriame Romos paveldo liekanas. Šie daiktai buvo rasti per kasimo darbams miestuose, kurie periodiškai vyko iš XVIII amžiuje XVI intervalu.

1963, institucija buvo pervadintas Istorija, Archeologija ir etnografijos muziejus, ir tapo žinomas kaip "muziejus Aquitaine". 1987 metais muziejus perkeltas į buvusios Menų fakulteto ir mokslo ministerija, kuri buvo pastatyta vėlai XIX amžiuje vienuolyno, žinomas kaip laidojimo vieta rašytojo ir filosofo Michel de Montaigne svetainėje pastate. Akvitanija muziejus, įsikūręs netoli Šv Andriejaus katedra.

2009 metais muziejus atidarytas naujas patalpas, skirtus tokio sudėtingo tema Prancūzijos kolonijinės vergovės ir prekybos žmonėmis istorija. Bordo, Nantas yra antras po uostą, per kurį Europa atėjo juodųjų vergų. Tiesiog Bordo buvo pristatytas maždaug 130 tūkstančių vergų. Muziejuje eksponuojama dokumentus ir kitus eksponatus, pasakoja apie gyvenimo ir darbo sąlygas vergų už riaušių ir išbėga bausmės.

Šiuo metu muziejaus plotas yra daugiau kaip 5000 kvadratinių metrų. m, o kolekcija artefaktus turi apie 70 tūkstančių eksponatų. Visi šie daiktai, dokumentai ir meno kūriniai atstovauti istorinio regiono Aquitaine ir jos pagrindinių miesto Bordo istoriją. Seniausi eksponatai datuojami priešistorinio kolekcijos eros, daugelis eksponatų yra įvairaus amžiaus liudijimai - Roman, ankstyvosios krikščionybės, viduramžių. Taip pat muziejuje galima pamatyti parodą, skirtą jūrų istorija Bordo, iš Afrikos ir Okeanijos tautų menas.