1546 ji buvo įkurta Arica miesto vietoje, pavadintoje "El Chenchorro. Praėjus penkiasdešimčiai metų miestas buvo nuniokotas žemės drebėjimo ir cunamio, kuris priverstinio gyventojus perkelti savo namus į uostą pagal Žaliojo Morro apsaugos, toje vietoje, kur jis yra dabar.

Dabartinė pastatas Arica katedra buvo pastatyta ant antrosios šventyklos miestas, kuris buvo pastatytas 1640 griuvėsiai. Po 200 metų tarnybos, ši bažnyčia buvo sugriauta žemės drebėjimo 1868 metais. Tik konservuoti akmeniniais laiptais. Naujos bažnyčios pastato projektą užsakė Peru prezidentas Jose Balta Prancūzijos studijoje Gustave Eiffel, ir iš pradžių buvo skirtas Ancon kurorte. Bet 1875 metais buvo nuspręsta statyti Arica. Po metų, šventykla buvo surengtas pirmą Mišias.

Per Ramiojo vandenyno karo (1879-1883) pradėjo priklauso Arica miesto Čilėje. Tačiau iki XX amžiaus atvykus, Arica liko pagal Arequipa vyskupijos vadovybė, pagal Vatikano dekretą. 1910, iš Arica, Maximo Lira miesto meras paskelbė apie Peru kunigo išsiuntimo ir jo asistentas iš šalies. Jie buvo pakeisti Čilės karinių kapelionų.

1911 Bažnyčia buvo pridėtas prie Tarapacá vyskupijoje (dabar - apie Iquique vyskupijos). Ir 1959 metais jis buvo perkeltas į katedrą rangą. Su popiežiaus Jono Pauliaus II palaiminimo 1986, ji buvo įkurta Arica vyskupijos miesto centre Šv Morkaus katedros Arica.

Bažnyčia yra santykinai mažas, gotikos stiliaus. Bažnyčios dizainas yra pagamintas iš metalo - sijos, kolonos, prijungtas smailiomis arkomis, išskyrus dvi medinės durys. Šventyklos bokštas pakyla į dangų, suteikiant grožį ir didingumą pastato, kurį dar labiau sustiprina supančio kraštovaizdžio: Plaza de Colón, Cape Morro de Arica, uosto, uosto ir beribis jūros.

1984 metais Katedros pastatas paskelbtas nacionaliniu paminklu Čilėje. Ir 2002 - istorinis paminklas Arica.