Katedros Arekipa yra vienas iš seniausių religinių pastatų mieste. Pirmoji bažnyčia buvo pastatyta 1544 m architekto Peter Godinez pagal iš Kusko Bishop, Don Vicente de Fray Velarde globoja. 1583 žemės drebėjimas sugriovė šventyklą. 1590 buvo atkurta bažnyčia pastatas, bet ne ilgam. 1600, dėl ugnikalnio išsiveržimo Huainaputina, bažnyčia buvo iš dalies sunaikinta dar kartą. Tuo XVII amžiaus pradžioje, Paulius V įkurta Arequipa vyskupiją, o vietoj senosios bažnyčios nuo 1621 iki 1656 buvo pastatyta katedra. Po sunkios gaisro 1844 m Katedros pastatas galėjo atkurti architektas Lukas Poblete ir su vyskupo Jose Sebastian de Goyenesh ir Barreda paramos 1868.

2001 birželio Arequipa miestas buvo pažeistas žemės drebėjimo 8, 1 pagal Richterio skalę. Vienas bokštą Katedros buvo visiškai sunaikinta, nava, kad rūsiai, o antrasis bokštas buvo smarkiai pažeista. Po metų, jos sukakties, Katedros visiškai atstatyta pagal Juan Manuel Guillen kryptimi.

Katedra pastatyta išvalytų ugnikalnio akmenų ir plytų neorenesanso su kai gotikos įtaka. Pagrindinis šventykla miesto, esančio šiaurinėje pusėje Plaza de Armas istorinio centro Arekipa. Jo fasadas susideda iš septyniasdešimties kolonos su Korinto sostinių, trijų durų ir dviejų didelių šoninių lankų.

Šventyklos altorius pagamintas iš Carrara marmuras, Felipe Maratillo darbą. Unikalus pirmininkas raižyti ąžuolo padarė prancūzų menininkas Rigo Karoliukai iš Lilis. Į Katedros parduotuvėse tauriųjų meno kūrinius, pagamintų Ispanijoje menininko-juvelyras Franciskas Maratillo, sidabro karūna Elžbieta II ir daugelis kitų dalykų dovanotos Vyskupų Goyeneshem ir jo šeimos tarybos muziejuje.